Quy định rõ điều kiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào tại Luật. Trong đó, bổ sung quy định về điều kiện có chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào, trừ hàng hoá, dịch vụ mua từng lần có giá trị dưới hai mươi triệu đồng.
Thanh toán qua ngân hàng là chủ trương lớn của Đảng và Nhà nước. Chính phủ đang triển khai đề án “thanh toán không dùng tiền mặt”. Việc lựa chọn hình thức thanh toán là quyền của doanh nghiệp nhưng để được khấu trừ, hoàn thuế giá trị gia tăng từ ngân sách Nhà nước thì doanh nghiệp phải thực hiện điều kiện thanh toán qua ngân hàng. Thực tiễn hiện nay việc thanh toán qua ngân hàng được áp dụng rộng rãi trong quan hệ mua, bán hàng hoá, dịch vụ giữa doanh nghiệp với doanh nghiệp, giữa doanh nghiệp với Nhà nước; đối với quan hệ mua, bán hàng hoá, dịch vụ giữa doanh nghiệp, Nhà nước với dân cư, thanh toán phổ biến dưới hình thức tiền mặt. Để góp phần thúc đẩy việc thanh toán không dùng tiền mặt, ngăn chặn các hành vi mua bán, sử dụng hoá đơn bất hợp pháp, gian lận trong khấu trừ, hoàn thuế giá trị gia tăng , chống thất thu ngân sách, tạo môi trường kinh doanh bình đẳng, lành mạnh, cần có quy định điều kiện để được khấu trừ thuế, hoàn thuế phải thực hiện thanh toán qua ngân hàng trong các quan hệ thanh toán giữa doanh nghiệp với doanh nghiệp, doanh nghiệp với Nhà nước. Theo đó, quy định về điều kiện có chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào, trừ hàng hoá, dịch vụ mua từng lần có giá trị dưới hai mươi triệu đồng đã có tính tới tình hình thực tế và khả thi trong quá trình thực hiện.
